Agli inizi del 1999 il premier indiano Vajpayee e quello pakistano Nawaz Sharif si incontrarono a Lahore. L’accordo raggiunto, che impegnava i due stati a risolvere i contrasti al fine di prevenire il rischio di un’escalation nucleare nella regione, ebbe tuttavia breve durata; in marzo entrambi i paesi effettuarono test balistici con missili in grado di portare ordigni nucleari. Nello stesso mese Vajpayee perse la maggioranza e fu costretto a dimettersi; falliti due tentativi di Sonia Gandhi di costituire un nuovo governo, il presidente Narayanan sciolse le camere e chiamò l’India alle urne per la terza volta in tre anni.

In questo clima di grave instabilità politica, aggravato peraltro dalla recrudescenza della violenza religiosa nel Kerala e nel Tamil Nadu e dalla guerriglia separatista nell’Assam, l’India si trovò a fronteggiare anche la ripresa del conflitto nel Kashmir, nel cui territorio si erano infiltrate, sostenute dal Pakistan, formazioni fondamentaliste islamiche.

Preso il sopravvento sui preesistenti movimenti indipendentisti kashmiri (più moderati e disposti al dialogo con il governo di New Delhi), nella primavera del 1999 la guerriglia islamista scatenò una violenta offensiva, alla quale l’India rispose con un intenso bombardamento aereo delle postazioni separatiste.

Nelle elezioni svoltesi tra settembre e ottobre 1999 il BJP, il Partito nazionalista indù, si impose nuovamente sul Congress-I e il suo leader Vajpayee tornò alla guida del governo.

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