Tra la Cordigliera Centrale e quella Settentrionale, che corre parallela alla prima, è situata la valle del Cibao, la quale, insieme alla pianura costiera sudorientale, costituisce la zona irrigua più fertile del paese. Infine le coste, assai accidentate, sono incise da numerose baie – tra cui quella di Carreras e quella di Samaná – alcune delle quali formano porti naturali.

Tra i numerosi corsi d’acqua si possono menzionare, nella regione settentrionale, lo Yaque del Norte, lo Yuna e il Camù, e in quella meridionale, lo Yaque del Sur, l’Ozama e il Soco. Il lago principale è l’Enriquillo, un ampio bacino d’acqua salata posto nella sezione sudoccidentale dello stato.