Muchos intelectuales checos fueron conducidos al exilio y el resto obligado a convertirse al catolicismo. Como resultado de esta derrota, Bohemia perdió su poder. Bajo el gobierno de los Habsburgo se incrementó la influencia de la lengua, la educación, la administración y la cultura alemana, situación que se prolongó durante más de un siglo.

Aunque las ciudades estaban pobladas principalmente por población alemana, muchos campesinos checos emigraron a estos grandes centros por el desarrollo de la industria en Bohemia y Moravia. . Los escritores, periodistas e intelectuales intentaron crear una mayor conciencia nacional entre los checos a mediados del siglo XVIII,

pero fue en la segunda mitad del siglo XIX cuando se desarrolló un auténtico movimiento popular nacionalista entre la población y los dirigentes, para unir las nacionalidades checa y eslovaca, separadas desde el siglo X. El más destacado de ellos fue Tomás Garrigue Masaryk, que se convirtió en el primer presidente de la República de Checoslovaquia, así proclamada como estado soberano en 1918, tras la desintegración del Imperio Austro-Húngaro.

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