En esta región se encuentran los ríos de San Pedro, Palizada, Chumpán, Candelaria y Mamantel, y en la parte media del estado el río Champotón. Las lagunas son las de: laguna Términos, Pom, Atasta, Corte y San Carlos; las cuatro últimas desembocan unas en otras.
El clima predominante es cálido subhúmedo, con escasa oscilación térmica anual y lluvias en verano y principios de otoño. En la parte sur las precipitaciones aumentan debido a los vientos nortes. Según la vegetación se puede clasificar el estado en cuatro regiones: en la Costa abundan el mangle, tule, las palmeras, los cocoteros, la palma real, el guano y el cocoyol; en la región de la Montaña existen árboles de maderas preciosas y semipreciosas (cedro, granadillo, guayacán, caoba, pich y chacá); en la Selva crece el cedro, la caoba, el ciricote y el achiote, palmeras, y árboles frutales como el mamey y chicozapote; por último, en la región de los Ríos la vegetación es parecida a la de las regiones de la costa y de la selva. Con relación a la fauna: en la Costa existen lagartos, manatíes, tortugas y culebras de agua; en la Montaña hay venados, armadillos, pavos de monte, tuzas, tepezcuintles, serpientes y conejos, entre otros; en la Selva habitan el mono araña, monos saraguatos, pumas, jaguares, tigrillos, jabalíes, venados, ocofaisanes, loros y chachalacas; y en la región de los Ríos viven nutrias, garzas, cocodrilos, tortugas, pelícanos y cigüeñas.